El peso molecular de una proteína es uno de los números más frecuentemente necesarios en un flujo de trabajo de biología molecular o bioquímica — para la interpretación de geles SDS-PAGE, para convertir entre masa y concentración molar, y para comparar una muestra purificada con su tamaño esperado. Esta calculadora te da tanto una estimación rápida solo a partir del conteo de residuos como un resultado exacto a partir de una secuencia de aminoácidos pegada.
Cómo funciona la Calculadora de Peso Molecular de Proteínas
Cuando pegas una secuencia completa, la calculadora busca la masa promedio de residuo estándar de cada aminoácido (los valores ExPASy/ProtParam ampliamente usados) y las suma, luego resta una molécula de agua (18.015 Da) por cada enlace peptídico formado — una cadena de n residuos tiene (n − 1) enlaces, ya que formar cada enlace durante la síntesis de proteínas libera una molécula de agua vía condensación. Cuando solo tienes un conteo de residuos, la calculadora en cambio usa el conocido atajo de ~110 Da por residuo, que es simplemente el promedio práctico de las masas de residuo individuales de los 20 aminoácidos.
Los datos y qué significan
El conteo de residuos es simplemente el número de aminoácidos en la cadena — úsalo cuando conoces la longitud aproximada de la proteína pero no su secuencia exacta. El campo de secuencia acepta una cadena de código de aminoácido de una letra (por ejemplo, MKTAYIAK...); los espacios en blanco y saltos de línea se eliminan automáticamente, y cualquier carácter fuera de los 20 códigos estándar se rechaza con un mensaje que señala su posición. Tu secuencia se procesa completamente en tu navegador — nunca se escribe en la URL de la página ni en el almacenamiento local, a diferencia del conteo de residuos y las entradas de masa, que son seguras de compartir en un enlace. La masa (µg) es opcional y solo alimenta la pestaña de conversión Masa ↔ Moles.
Límites y casos extremos
La estimación por conteo de residuos es inherentemente aproximada — una proteína inusualmente rica en residuos pesados (triptófano, 186 Da) o ligeros (glicina, 57 Da) se desviará más del promedio de ~110 Da/residuo que una proteína con composición típica de aminoácidos. El cálculo de secuencia exacta no considera modificaciones postraduccionales (glicosilación, fosforilación, enlaces disulfuro, escisión de péptido señal, y similares), todas las cuales cambian la masa real medida de una proteína real. Los códigos ambiguos o no estándar (X, B, Z, U, y residuos modificados en minúscula) no son reconocidos — solo se admiten los 20 códigos estándar de aminoácido de una letra.