A expressão gênica transforma uma sequência de DNA em uma proteína funcional por meio de duas etapas: transcrição (DNA em mRNA) e tradução (mRNA em cadeia de aminoácidos). Esta calculadora percorre uma sequência de DNA colada em ambas as etapas, além de mostrar as cadeias complementares de DNA, para que você possa verificar o dever de casa, os resultados do laboratório ou apenas criar uma intuição sobre como o código genético funciona.

Como funcionam a transcrição e a tradução aqui

A transcrição copia uma fita de DNA em uma molécula de mRNA de fita simples, trocando a timina (T) por uracila (U). Se você colar a cadeia de codificação (sentido) – a cadeia que já lê o mesmo que o mRNA, exceto T/U – a calculadora troca T por U diretamente. Se você colar a fita modelo (antisense), ela primeiro calcula o complemento reverso dessa fita (recuperando a sequência da fita codificadora) e, em seguida, faz a mesma troca de T para U. A tradução então lê o mRNA em códons de três letras não sobrepostos começando na primeira base - isso é chamado de quadro de leitura 1. Cada códon é mapeado para um aminoácido por meio do código genético padrão (a mesma tabela de 64 códons usada em quase toda a vida conhecida). A tradução para assim que atinge um dos três códons de parada (UAA, UAG, UGA); tudo depois desse ponto não é traduzido, mesmo que restem mais bases.

Lendo as três guias de resultados

A guia mRNA é a saída principal: a sequência transcrita, seu comprimento e sua composição de base (contagens de A, U, G, C). A guia Proteína (Tradução) mostra a cadeia de aminoácidos resultante como uma lista de nomes completos (Met-Ala-...) e um código compacto de uma letra (MA...), além de uma tabela códon por códon que você pode exportar para CSV. A guia Fitamentos do complemento mostra duas coisas sobre o seu DNA original: o complemento literal (cada base trocada, na mesma ordem) e o complemento reverso (a segunda fita real da dupla hélice, lida na direção normal de 5' para 3').

Limites e coisas para verificar

Essa ferramenta sempre lê a partir da primeira base do mRNA (quadro de leitura 1) — ela não procura um códon de início interno (ATG) no meio de uma sequência mais longa, portanto, se a sequência de codificação do seu gene real não começar exatamente onde você começou a colar, a tradução será deslocada para fora do quadro. Também aceita apenas as quatro bases padrão do DNA (A, T, G, C); códigos de ambiguidade como N, R ou Y (comuns em leituras de sequenciamento bruto) serão sinalizados como inválidos em vez de adivinhados. Para uso real em laboratório ou em cursos, sempre verifique o quadro de leitura e a orientação do fio em relação ao material de origem.