Frekuensi mutasi dan laju mutasi menggambarkan seberapa sering mutasi muncul dalam suatu populasi, namun keduanya menjawab pertanyaan yang sedikit berbeda. Kalkulator ini menghitung dari penghitungan sederhana — mutan, total populasi, dan (opsional) jumlah generasi — sehingga Anda dapat dengan cepat memeriksa apakah jumlah mutan yang diamati berada dalam kisaran yang diharapkan atau terlalu tinggi.

Cara kerja kalkulator

Frekuensi mutasi adalah rasio langsung: jumlah mutan yang Anda hitung dibagi dengan total populasi sampel (frekuensi = mutan / total). Ini adalah gambaran populasi pada satu titik waktu dan tidak memiliki dimensi waktu — frekuensi yang sama dapat muncul dari budaya yang tumbuh cepat selama beberapa generasi atau budaya yang tumbuh lambat dalam banyak generasi.

Laju mutasi menambahkan dimensi waktu dengan membagi frekuensi dengan jumlah generasi yang dilewati populasi (rate = frekuensi / generasi). Ini merupakan penyederhanaan probabilitas mutasi per generasi yang sebenarnya: karena mutasi yang muncul pada awal pertumbuhan diwarisi oleh banyak sel keturunannya, sedangkan mutasi yang muncul pada generasi terakhir hanya muncul pada beberapa sel, maka pembagian berdasarkan generasi cenderung meremehkan laju mutasi lama dan melebih-lebihkan laju mutasi baru. Untuk memperkirakan laju secara teliti, peneliti menggunakan uji fluktuasi Luria-Delbrück atau penduga kemungkinan maksimum (misalnya metode Ma-Sandri-Sarkar) yang diterapkan pada banyak budaya paralel.

Masukan dan artinya

Jumlah mutan — jumlah individu, sel, atau koloni yang diidentifikasi membawa mutasi, biasanya berdasarkan fenotipe yang dapat dipilih (resistensi antibiotik, kebutuhan nutrisi, fluoresensi, dll.).

Total populasi — jumlah total sel atau individu dalam sampel, wadah, atau kultur tempat mutan diambil. Harus lebih besar dari jumlah mutan.

Jumlah generasi (hanya tab Nilai) — berapa putaran pembelahan atau reproduksi sel yang dialami suatu populasi sebelum pengambilan sampel. Perkirakan hal ini dari penggandaan waktu dan durasi budaya, atau dari jumlah generasi langsung jika dilacak.

Batasan dan kasus tepi

Kalkulator ini menggunakan perkiraan frekuensi sederhana dari generasi ke generasi, yang cukup untuk perkiraan cepat namun bukan pengganti uji fluktuasi yang tepat ketika presisi penting (misalnya mempublikasikan tingkat mutasi). Hal ini juga mengasumsikan peristiwa mutasi tunggal yang seragam sedang dihitung - menggabungkan beberapa jenis mutasi yang berbeda ke dalam satu penghitungan "mutan" akan mengecilkan betapa jarangnya mutasi individu sebenarnya. Total populasi yang sangat kecil (di bawah beberapa ratus) membuat perkiraan frekuensi menjadi rumit karena satu mutan tambahan atau hilang mengubah rasio secara signifikan — ukuran sampel yang lebih besar menghasilkan frekuensi yang lebih dapat diandalkan.