Ekspresi gen mengubah urutan DNA menjadi protein yang berfungsi melalui dua langkah: transkripsi (DNA ke mRNA) dan translasi (mRNA ke rantai asam amino). Kalkulator ini menelusuri urutan DNA yang ditempel melalui kedua langkah, dan juga menampilkan untaian DNA komplementer, sehingga Anda dapat memeriksa pekerjaan rumah, hasil lab, atau sekadar membangun intuisi tentang cara kerja kode genetik.

Cara kerja transkripsi dan terjemahan di sini

Transkripsi menyalin satu untai DNA menjadi molekul mRNA untai tunggal, menukar timin (T) dengan urasil (U). Jika Anda menempelkan untai pengkode (akal) — untai yang sudah terbaca sama dengan mRNA kecuali T/U — kalkulator menukar T dengan U secara langsung. Jika Anda menempelkan untai templat (antisense), pertama-tama ia menghitung komplemen balik untai tersebut (memulihkan urutan untai pengkode), lalu melakukan pertukaran T-ke-U yang sama.

Penerjemahan kemudian membaca mRNA dalam kodon tiga huruf yang tidak tumpang tindih, mulai dari basa pertama — ini disebut kerangka pembacaan 1. Setiap kodon dipetakan ke satu asam amino melalui kode genetik standar (tabel 64 kodon yang sama yang digunakan di hampir semua kehidupan yang diketahui). Penerjemahan berhenti segera setelah mencapai salah satu dari tiga kodon stop (UAA, UAG, UGA); segala sesuatu setelah titik itu tidak diterjemahkan, meskipun masih ada basis lain yang tersisa.

Membaca tiga tab hasil

Tab mRNA adalah keluaran utama: urutan yang ditranskripsi, panjangnya, dan komposisi dasarnya (hitungan A, U, G, C). Tab Protein (Terjemahan) menampilkan rantai asam amino yang dihasilkan dalam bentuk daftar nama lengkap (Met-Ala-...) dan kode satu huruf ringkas (MA...), ditambah tabel kodon demi kodon yang dapat Anda ekspor ke CSV. Tab Untaian Komplemen menampilkan dua hal tentang DNA asli Anda: komplemen literal (setiap basa tertukar, urutannya sama) dan komplemen terbalik (untai kedua heliks ganda yang sebenarnya, terbaca dalam arah normal 5' hingga 3').

Batasan dan hal-hal yang perlu diperiksa ulang

Alat ini selalu membaca dari basis pertama mRNA (bingkai pembacaan 1) — alat ini tidak mencari kodon awal internal (ATG) di tengah-tengah rangkaian yang lebih panjang, jadi jika rangkaian pengkodean gen Anda yang sebenarnya tidak dimulai tepat di tempat Anda mulai menempelkannya, terjemahannya akan bergeser keluar dari bingkai. Ia juga hanya menerima empat basa DNA standar (A, T, G, C); kode ambiguitas seperti N, R, atau Y (umum dalam pembacaan sekuensing mentah) akan ditandai sebagai tidak valid, bukan dapat ditebak. Untuk penggunaan nyata di laboratorium atau kursus, selalu periksa kembali kerangka bacaan dan orientasi untaian terhadap materi sumber Anda.