What formula does this calculator use for molecular weight?

It multiplies the sequence length by an average mass per base (or base pair for dsDNA) and adds a small fixed end-group adjustment: dsDNA = length × 617.96 + 36.04, ssDNA = length × 303.7 + 79, RNA = length × 320.5 + 159. These are standard sequence-independent approximations used throughout molecular biology.

Why do dsDNA and ssDNA give different molecular weights for the same length?

Double-stranded DNA length is measured in base pairs, where each unit represents two complementary nucleotides (one per strand). Single-stranded DNA and RNA length is measured per single nucleotide. That's why the per-unit mass used for dsDNA is roughly double the per-unit mass used for ssDNA.

How do I convert nanograms to picomoles?

Divide the mass in nanograms by the molecular weight in g/mol, then multiply by 1,000 to convert to picomoles: pmol = (mass_ng × 1000) / MW. The calculator's Mass ↔ Moles tab does this automatically once you've set the sequence type and length.

How is copy number calculated?

Copy number is the molar amount (in moles) multiplied by Avogadro's number (6.022 × 10²³ molecules per mole). The calculator first converts your picomole amount back to moles, then multiplies by Avogadro's number to give the total molecule count.

Is this molecular weight exact for my specific sequence?

No — it's a sequence-independent estimate based on the average mass per base. The exact molecular weight depends on the precise number of A, T/U, G, and C bases in your sequence, since each has a slightly different mass. For most lab calculations (ligation ratios, qPCR standards, transfection dosing) this estimate is accurate enough; use dedicated sequence-analysis software if you need the exact value for a known sequence.

Does this work for RNA the same way as DNA?

Yes — select RNA as the type and enter the length in nucleotides. RNA uses its own average mass per nucleotide (320.5 g/mol, slightly higher than ssDNA's 303.7 g/mol) because ribose sugar is heavier than the deoxyribose used in DNA.

Kalkulator Berat Molekul DNA - Massa & Mol

📋

Panduan langkah demi langkah

Cara menggunakan kalkulator ini

4 langkah

1

Pilih jenis urutan

Pada tab Berat Molekuler, pilih apakah urutan Anda adalah DNA beruntai ganda (dsDNA), DNA beruntai tunggal (ssDNA), atau RNA. Setiap jenis memiliki massa rata-rata yang berbeda per basa atau pasangan basa, jadi perkiraannya bergantung pada cara melakukannya dengan benar.

2

Masukkan panjang urutan

Masukkan panjang pasangan basa untuk dsDNA, atau nukleotida untuk ssDNA dan RNA. Kartu hasil diperbarui secara instan dengan perkiraan berat molekul dalam g/mol dan kDa.

3

Ubah massa menjadi mol

Beralih ke tab Massa ↔ Mol dan masukkan massa dalam nanogram (misalnya, dari spektrofotometer atau pembacaan Qubit) untuk mengubahnya menjadi pikomol menggunakan berat molekul dari langkah 2.

4

Dapatkan nomor salinannya

Tab Nomor Salinan menggunakan massa dan berat molekul yang sama untuk menghitung jumlah molekul DNA atau RNA individu yang ada, menggunakan bilangan Avogadro.

⚡

Referensi

Rumus dan metodologi

3 rumus

Berat molekul dari panjang dan jenis

dsDNA: MW = length × 617.96 + 36.04 (bp) ssDNA: MW = length × 303.7 + 79 (nt) RNA: MW = length × 320.5 + 159 (nt)

Setiap nukleotida (atau pasangan basa, untuk DNA beruntai ganda) menyumbangkan massa rata-rata pada molekul, ditambah sedikit penyesuaian tetap untuk kelompok ujung 5' dan 3'. Hal ini memberikan perkiraan yang tidak bergantung pada urutan - berat molekul sebenarnya dari suatu urutan nyata sedikit berbeda dengan komposisi basa pastinya, karena A, T, G, dan C masing-masing memiliki massa yang berbeda.

Massa ke mol (ng ke pmol)

pmol = (mass in ng × 1000) / MW (g/mol)

Mol = massa ÷ berat molekul. Bekerja dalam nanogram dan pikomol (bukan gram dan mol) menjaga angka-angka dalam kisaran yang sesuai untuk besaran laboratorium pada umumnya, sehingga kalkulator menerapkan konversi satuan ng-ke-g dan mol-ke-pmol secara internal.

Salin nomor

copies = (pmol / 1e12) × 6.022 × 10^23

Nomor salinan adalah jumlah molekul DNA atau RNA individu dalam suatu sampel. Ini dihitung dengan mengubah jumlahnya kembali menjadi mol dan mengalikannya dengan bilangan Avogadro — jumlah molekul dalam satu mol zat apa pun.

📖

Glosarium

Penjelasan istilah penting

7 istilah

Massa satu mol suatu molekul, dinyatakan dalam gram per mol (g/mol) atau, untuk molekul besar seperti DNA, dalam kilodalton (kDa). Untuk DNA dan RNA diperkirakan dari panjang urutan dan massa rata-rata per basa atau pasangan basa.

Dua nukleotida komplementer (AT atau G-C) bergabung melintasi dua untai molekul DNA untai ganda. Panjang DNA beruntai ganda diukur dalam pasangan basa; Panjang DNA dan RNA untai tunggal diukur dalam nukleotida (nt).

Satuan massa molekul yang sama dengan satu satuan massa atom, yang secara numerik setara dengan 1 g/mol. Biomolekul besar seperti DNA sering dilaporkan dalam kilodalton (kDa), dimana 1 kDa = 1.000 Da.

Tiga jenis keterdamparan yang didukung kalkulator ini: DNA beruntai tunggal, DNA beruntai ganda, dan RNA. Masing-masing memiliki rata-rata per satuan massa yang berbeda, karena gula ribosa RNA dan untaian berpasangan dsDNA mengubah massa rata-rata per basa.

Satu triliun (10⁻¹²) mol — satuan yang sesuai untuk jumlah molar kecil DNA atau RNA yang biasanya ditangani di laboratorium biologi molekuler.

Jumlah molekul individu dari rangkaian DNA atau RNA tertentu yang ada dalam sampel, dihitung dari jumlah molar (mol) menggunakan bilangan Avogadro.

Kependekan dari oligonukleotida — rangkaian DNA atau RNA sintetik beruntai tunggal pendek (biasanya di bawah 100–200 basa), biasanya digunakan sebagai primer atau probe.

👥

Skenario

Contoh dalam kehidupan nyata

3 contoh nyata

🧬

Memperkirakan berat molekul sisipan plasmid

Fragmen dsDNA 1.000 bp

Ketik dsDNA Panjangnya 1.000bp

MW = 1.000 × 617,96 + 36,04 = 617.996,04 g/mol, atau sekitar 618 kDa. Estimasi yang tidak bergantung pada urutan ini cukup mendekati untuk sebagian besar perhitungan kloning dan rasio molar tanpa memerlukan komposisi dasar yang tepat.

🧪

Mengubah pembacaan Qubit menjadi pikomol

100 ng dari fragmen dsDNA 1.000 bp yang sama

Massa 100ng MW 617,996.04 g/mol

pmol = (100 × 1.000) / 617.996,04 ≈ 0,162 pmol. Ini adalah jumlah yang akan Anda gunakan untuk menghitung rasio molar untuk ligasi atau kurva standar qPCR.

🔢

Menemukan nomor salinan untuk standar qPCR

Sampel dsDNA 100 ng, 1.000 bp yang sama

tahi lalat ≈ 0,162 pmol nomor Avogadro 6.022 × 10²³

salinan = (0,162 / 1e12) × 6,022 × 10²³ ≈ 9,76 × 10¹⁰ salinan. Ini adalah angka yang akan Anda encerkan untuk membuat kurva standar untuk kuantifikasi absolut dengan qPCR.

🔗

Referensi

Sitasi kalkulator ini

APA & MLA

Gunakan salah satu format ini untuk menyitasi kalkulator dalam makalah, laporan, atau daftar sumber.

APA

MLA

📄

Ulasan mendalam

Memperkirakan Berat Molekul DNA dan RNA

3 bab · 4 menit membaca

Mengetahui berat molekul rangkaian DNA atau RNA adalah langkah pertama untuk mengkonversi antara massa, mol, dan nomor salinan molekul — angka yang selalu muncul saat menyiapkan ligasi, standar qPCR, atau transfeksi. Kalkulator ini memberikan perkiraan yang cepat dan tidak bergantung pada urutan hanya dari panjang dan keterdamparan urutan Anda, kemudian rantai yang memperkirakan menjadi konversi massa ke mol dan jumlah salinan.

Mengapa perkiraan tidak memerlukan urutan sebenarnya

Berat molekul pasti suatu molekul DNA atau RNA bergantung pada jumlah pasti setiap basa (A, T/U, G, C) yang dikandungnya, karena setiap nukleotida memiliki massa yang sedikit berbeda. Untuk sebagian besar tujuan praktis – kloning, PCR, dosis transfeksi – tingkat presisi seperti itu tidak diperlukan. Sebaliknya, kalkulator ini menggunakan massa rata-rata per basa (atau pasangan basa, untuk DNA beruntai ganda) yang ditetapkan berdasarkan referensi biologi molekuler standar, yang akurat hingga sepersekian persen untuk rangkaian tipikal. Penyesuaian gugus akhir tetap yang kecil (36,04 untuk dsDNA, 79 untuk ssDNA, 159 untuk RNA) menjelaskan gugus fosfat terminal dan hidroksil di ujung molekul.

Mengapa dsDNA, ssDNA, dan RNA memberikan jawaban berbeda untuk panjang yang sama

Molekul DNA beruntai ganda dengan 1.000 pasangan basa mengandung 2.000 nukleotida individu — dua untai komplementer — sehingga massa per unitnya (617,96 g/mol per bp) mencerminkan gabungan kedua untai. Molekul DNA atau RNA beruntai tunggal dengan panjang numerik yang sama hanya memiliki setengah jumlah total nukleotida, sehingga massanya dihitung per nukleotida tunggal (303,7 g/mol/nt untuk ssDNA, 320,5 g/mol/nt untuk RNA). RNA sedikit lebih berat per nukleotidanya dibandingkan ssDNA karena gula ribosanya membawa atom oksigen ekstra dibandingkan dengan deoksiribosa DNA. Selalu konfirmasikan jenis urutan Anda sebenarnya sebelum membandingkan berat molekul di seluruh eksperimen.

Dari berat molekul hingga nomor salinan

Setelah Anda mengetahui berat molekul, mengubah massa terukur (dari spektrofotometer, Qubit, atau kuantifikasi gel) menjadi jumlah molar hanya dengan satu pembagian: mol = massa Mbps. Dari sana, mengalikannya dengan bilangan Avogadro (6,022 × 10²³ molekul per mol) menghasilkan nomor salinan — jumlah sebenarnya molekul DNA atau RNA dalam sampel Anda. Rantai konversi inilah yang diperlukan untuk menyiapkan rangkaian pengenceran untuk kurva standar kuantifikasi absolut qPCR, atau untuk menghitung rasio molar untuk reaksi ligasi.

❓

Pertanyaan

Pertanyaan umum

6 pertanyaan

Rumus apa yang digunakan kalkulator ini untuk berat molekul?+

Ini mengalikan panjang urutan dengan massa rata-rata per basa (atau pasangan basa untuk dsDNA) dan menambahkan penyesuaian kelompok akhir tetap kecil: dsDNA = panjang × 617,96 + 36,04, ssDNA = panjang × 303,7 + 79, RNA = panjang × 320,5 + 159. Ini adalah perkiraan independen urutan standar yang digunakan di seluruh biologi molekuler.

Mengapa dsDNA dan ssDNA memberikan berat molekul berbeda untuk panjang yang sama?+

Panjang DNA untai ganda diukur dalam pasangan basa, di mana setiap unit mewakili dua nukleotida komplementer (satu per untai). Panjang DNA dan RNA untai tunggal diukur per nukleotida tunggal. Itu sebabnya massa per unit yang digunakan untuk dsDNA kira-kira dua kali lipat massa per unit yang digunakan untuk ssDNA.

Bagaimana cara mengubah nanogram menjadi pikomol?+

Bagi massa dalam nanogram dengan berat molekul dalam g/mol, lalu kalikan dengan 1.000 untuk mengubahnya menjadi pikomol: pmol = (mass_ng × 1000) / MW. Tab Massa ↔ Mol pada kalkulator melakukan hal ini secara otomatis setelah Anda mengatur jenis dan panjang urutan.

Bagaimana cara menghitung jumlah salinan?+

Nomor salinan adalah jumlah molar (dalam mol) dikalikan dengan bilangan Avogadro (6,022 × 10²³ molekul per mol). Kalkulator terlebih dahulu mengubah jumlah pikomol Anda menjadi mol, lalu mengalikannya dengan bilangan Avogadro untuk mendapatkan jumlah total molekul.

Apakah berat molekul ini tepat untuk urutan spesifik saya?+

Tidak — ini adalah perkiraan yang tidak bergantung pada urutan berdasarkan massa rata-rata per basa. Berat molekul pastinya bergantung pada jumlah pasti basa A, T/U, G, dan C dalam rangkaian Anda, karena masing-masing basa memiliki massa yang sedikit berbeda. Untuk sebagian besar perhitungan laboratorium (rasio ligasi, standar qPCR, dosis transfeksi) perkiraan ini cukup akurat; gunakan perangkat lunak analisis urutan khusus jika Anda memerlukan nilai pasti untuk urutan yang diketahui.

Apakah ini bekerja untuk RNA dengan cara yang sama seperti DNA?+

Ya — pilih RNA sebagai jenisnya dan masukkan panjangnya dalam nukleotida. RNA menggunakan massa rata-rata per nukleotidanya sendiri (320,5 g/mol, sedikit lebih tinggi dari ssDNA yang 303,7 g/mol) karena gula ribosa lebih berat daripada deoksiribosa yang digunakan dalam DNA.

Unduh PDF satu halaman berisi hasil Anda. Masukkan alamat email untuk menerima kiat kalkulator sesekali. Tanpa spam, dan Anda dapat berhenti berlangganan kapan saja. Privasi.

Kalkulator Berat Molekul DNA

Urutan

Hasil

Massa ke tahi lalat

Hasil

Salin nomor

Hasil

Cara menggunakan kalkulator ini

Pilih jenis urutan

Masukkan panjang urutan

Ubah massa menjadi mol

Dapatkan nomor salinannya

Rumus dan metodologi

Penjelasan istilah penting

Contoh dalam kehidupan nyata

Memperkirakan berat molekul sisipan plasmid

Mengubah pembacaan Qubit menjadi pikomol

Menemukan nomor salinan untuk standar qPCR

Sitasi kalkulator ini

Memperkirakan Berat Molekul DNA dan RNA

Mengapa perkiraan tidak memerlukan urutan sebenarnya

Mengapa dsDNA, ssDNA, dan RNA memberikan jawaban berbeda untuk panjang yang sama

Dari berat molekul hingga nomor salinan

Pertanyaan umum

Dapatkan PDF hasil dengan merek Calculover

Kalkulator Berat Molekul DNA

Urutan

Hasil

Massa ke tahi lalat

Hasil

Salin nomor

Hasil

Cara menggunakan kalkulator ini

Pilih jenis urutan

Masukkan panjang urutan

Ubah massa menjadi mol

Dapatkan nomor salinannya

Rumus dan metodologi

Penjelasan istilah penting

Contoh dalam kehidupan nyata

Sitasi kalkulator ini

Memperkirakan Berat Molekul DNA dan RNA

Mengapa perkiraan tidak memerlukan urutan sebenarnya

Mengapa dsDNA, ssDNA, dan RNA memberikan jawaban berbeda untuk panjang yang sama

Dari berat molekul hingga nomor salinan

Pertanyaan umum

Dapatkan PDF hasil dengan merek Calculover

Jelajahi lebih lanjut

kalkulator terkait

Panduan & artikel