Le principe de Hardy-Weinberg sert de référence pour mesurer l’évolution : il décrit les fréquences alléliques et génotypiques d’une population qui n’évoluerait PAS. Comparer les effectifs génotypiques d’une population réelle à cette référence est l’un des moyens les plus simples de détecter l’action de la sélection, de la migration, d’accouplements non aléatoires ou de la dérive génétique.
Fonctionnement du calculateur Hardy-Weinberg
Le calculateur applique les deux équations centrales de Hardy-Weinberg : p + q = 1 pour les fréquences alléliques et p² + 2pq + q² = 1 pour les fréquences génotypiques, où p est la fréquence de l’allèle dominant et q celle de l’allèle récessif. « À partir des allèles » calcule directement les trois fréquences génotypiques à partir de p. « À partir des génotypes » correspond au cas courant où seul le phénotype récessif peut être compté dans un échantillon : q est estimé par la racine carrée de la fréquence observée du génotype récessif, puis p est déduit. « Vérification de l’équilibre » procède dans l’autre sens : à partir des effectifs génotypiques complets, p est estimé par comptage direct des allèles, les fréquences attendues selon Hardy-Weinberg sont calculées puis comparées aux observations.
Paramètres et signification
La fréquence allélique p est comprise entre 0 et 1 et représente la proportion de l’allèle dominant dans le pool génétique ; q = 1 − p est toujours calculé, jamais saisi directement. Les effectifs génotypiques (homozygotes dominants, hétérozygotes, homozygotes récessifs) sont les nombres bruts d’individus observés ou génotypés. Les deux onglets fondés sur les effectifs utilisent les mêmes trois valeurs différemment : « À partir des génotypes » suppose que seul le phénotype récessif peut être identifié de manière fiable ; « Vérification de l’équilibre » suppose que les trois génotypes sont distinguables, par exemple au moyen d’un test génétique ou d’un marqueur codominant.
Limites et cas particuliers
Ce calculateur prend en charge exactement deux allèles par gène. Les gènes à trois allèles ou plus (comme les groupes sanguins humains) nécessitent une version étendue des équations, qui n’est pas modélisée ici. Le modèle de Hardy-Weinberg suppose une grande population, des accouplements aléatoires et l’absence de sélection, de mutation ou de migration. Les populations réelles s’écartent plus ou moins de ces hypothèses ; comparer les effectifs observés aux prédictions du modèle est donc utile : un écart important signale qu’une hypothèse n’est pas respectée, et non que les calculs sont erronés. La vérification signale les écarts à l’aide d’un simple seuil en points de pourcentage, et non d’un test statistique formel. Considérez tout écart signalé comme une piste à examiner, pas comme une conclusion définitive.