La fréquence allélique est le point de départ de presque tous les calculs en génétique des populations : les valeurs p et q alimentent directement l’équation de Hardy-Weinberg, les modèles de sélection et les simulations de dérive génétique. Ce calculateur convertit instantanément les décomptes de génotypes ou d’allèles en p et q, afin de poursuivre les analyses qui en dépendent.
Pourquoi diviser par 2N et non par N ?
Chaque individu diploïde porte deux copies de chaque gène, une provenant de chaque parent. Une population de N individus possède donc un patrimoine de 2N copies alléliques pour ce gène, et non N. Un individu AA apporte deux copies de l’allèle A ; un individu aa apporte deux copies de l’allèle a ; un individu hétérozygote Aa apporte exactement une copie de chaque. Additionner les contributions de tous les individus et diviser par la taille totale du patrimoine (2N) donne la fréquence réelle de chaque allèle dans la population, et non la fréquence d’un génotype.
Décomptes de génotypes ou décomptes directs d’allèles
La plupart des exercices de manuel fournissent des décomptes de génotypes (nombre d’individus AA, Aa et aa observés), car c’est ce que mesurent généralement le phénotypage ou le génotypage sur le terrain. Certains jeux de données, notamment issus de pipelines de séquençage, indiquent directement le nombre brut de copies alléliques. Les deux méthodes de calcul de p et q sont mathématiquement équivalentes, une fois prise en compte la contribution d’une copie de chaque allèle par les hétérozygotes ; ce calculateur accepte les deux formats afin d’éviter une conversion manuelle.
À quoi servent ensuite les fréquences alléliques ?
p et q ne sont généralement pas le résultat final : ce sont les données d’entrée de l’équilibre de Hardy-Weinberg (p^2 + 2pq + q^2 = 1), qui prédit les fréquences génotypiques attendues lorsque la population n’évolue pas pour ce gène. En comparant les génotypes observés aux attentes de Hardy-Weinberg, les généticiens détectent la sélection, les accouplements non aléatoires ou la dérive génétique agissant sur un gène. Ce calculateur sert uniquement à obtenir p et q à partir de vos données ; utilisez-le comme première étape avant de vérifier l’équilibre.