Das Molekulargewicht von Proteinen ist eine der am häufigsten benötigten Zahlen in einem molekularbiologischen oder biochemischen Arbeitsablauf – für die SDS-PAGE-Gelinterpretation, für die Umrechnung zwischen Masse und molarer Konzentration und für den Vergleich einer gereinigten Probe mit ihrer erwarteten Größe. Dieser Rechner liefert Ihnen sowohl eine schnelle Schätzung allein anhand der Restzahl als auch ein genaues Ergebnis anhand einer eingefügten Aminosäuresequenz.

So funktioniert der Protein-Molekulargewichtsrechner

Wenn Sie eine vollständige Sequenz einfügen, sucht der Rechner nach der standardmäßigen durchschnittlichen Restmasse jeder Aminosäure (die weit verbreiteten ExPASy/ProtParam-Werte) und addiert sie. Anschließend subtrahiert er ein Wassermolekül (18,015 Da) für jede gebildete Peptidbindung – eine Kette von n Resten hat (n − 1) Bindungen, da bei der Bildung jeder Bindung während der Proteinsynthese durch Kondensation ein Wassermolekül freigesetzt wird. Wenn Sie nur eine Restanzahl haben, verwendet der Rechner stattdessen die bekannte Abkürzung von ~110 Da pro Rest, was einfach der praktische Durchschnitt der einzelnen Restmassen der 20 Aminosäuren ist.

Eingaben und was sie bedeuten

Die Anzahl der Reste ist nur die Anzahl der Aminosäuren in der Kette – verwenden Sie diese, wenn Sie die ungefähre Länge des Proteins, aber nicht seine genaue Sequenz kennen. Das Sequenzfeld akzeptiert eine aus einem Buchstaben bestehende Aminosäurecodezeichenfolge (z. B. MKTAYIAK...); Leerzeichen und Zeilenumbrüche werden automatisch entfernt und jedes Zeichen außerhalb der 20 Standardcodes wird mit einer Meldung zurückgewiesen, die auf seine Position verweist. Ihre Sequenz wird vollständig in Ihrem Browser verarbeitet – sie wird nie in die Seiten-URL oder in den lokalen Speicher geschrieben, anders als die Restanzahl und Masseneingaben, die sicher in einem Link geteilt werden können. Die Masse (µg) ist optional und versorgt nur die Registerkarte zur Umrechnung von Masse ↔ Mol.

Grenzen und Randfälle

Die Schätzung der Aminosäurerestanzahl ist von Natur aus ungefähr – ein Protein, das ungewöhnlich reich an schweren Aminosäureresten (Tryptophan, 186 Da) oder leichten Aminosäureresten (Glycin, 57 Da) ist, weicht stärker vom Durchschnitt von ~110 Da/Aminosäureresten ab als ein Protein mit typischer Aminosäurezusammensetzung. Die Berechnung der exakten Sequenz berücksichtigt keine posttranslationalen Modifikationen (Glykosylierung, Phosphorylierung, Disulfidbindungen, Signalpeptidspaltung und ähnliches), die alle die tatsächlich gemessene Masse eines realen Proteins verändern. Mehrdeutige oder nicht standardmäßige Codes (X, B, Z, U und modifizierte Reste in Kleinbuchstaben) werden nicht erkannt – es werden nur die 20 standardmäßigen Einzelbuchstaben-Aminosäurecodes unterstützt.