Die Genexpression verwandelt eine DNA-Sequenz in zwei Schritten in ein funktionierendes Protein: Transkription (DNA zu mRNA) und Translation (mRNA zu Aminosäurekette). Dieser Rechner führt eine eingefügte DNA-Sequenz durch beide Schritte und zeigt außerdem die komplementären DNA-Stränge an, sodass Sie Hausaufgaben und Laborergebnisse überprüfen oder einfach nur ein Gefühl dafür entwickeln können, wie der genetische Code funktioniert.

Wie Transkription und Übersetzung hier funktionieren

Die Transkription kopiert einen DNA-Strang in ein einzelsträngiges mRNA-Molekül und tauscht Thymin (T) gegen Uracil (U) aus. Wenn Sie den kodierenden (Sinn-)Strang einfügen – den Strang, der sich bis auf T/U bereits wie die mRNA liest – tauscht der Rechner T direkt gegen U aus. Wenn Sie stattdessen den Template-(Antisense-)Strang einfügen, wird zunächst das umgekehrte Komplement dieses Strangs berechnet (wodurch die Sequenz des codierenden Strangs wiederhergestellt wird) und dann derselbe T-zu-U-Austausch durchgeführt.

Die Übersetzung liest dann die mRNA in nicht überlappenden Drei-Buchstaben-Codons, beginnend mit der allerersten Base – dies wird Leserahmen 1 genannt. Jedes Codon wird über den standardmäßigen genetischen Code einer Aminosäure zugeordnet (dieselbe 64-Codon-Tabelle, die in fast allen bekannten Lebewesen verwendet wird). Die Translation stoppt, sobald sie eines der drei Stoppcodons (UAA, UAG, UGA) trifft; alles, was danach kommt, wird nicht übersetzt, auch wenn weitere Basen übrig bleiben.

Lesen der drei Ergebnisregisterkarten

Die Registerkarte mRNA ist die primäre Ausgabe: die transkribierte Sequenz, ihre Länge und ihre Basenzusammensetzung (Anzahl von A, U, G, C). Die Registerkarte Protein (Übersetzung) zeigt die resultierende Aminosäurekette sowohl als vollständige Namensliste (Met-Ala-...) als auch als kompakten Ein-Buchstaben-Code (MA...) sowie eine Codon-für-Codon-Tabelle, die Sie in CSV exportieren können. Auf der Registerkarte Komplementstränge werden zwei Dinge über Ihre ursprüngliche DNA angezeigt: das wörtliche Komplement (jede Base vertauscht, gleiche Reihenfolge) und das umgekehrte Komplement (der tatsächliche zweite Strang der Doppelhelix, gelesen in der normalen Richtung von 5' nach 3').

Grenzen und Dinge, die noch einmal überprüft werden müssen

Dieses Tool liest immer ab der allerersten Base der mRNA (Leserahmen 1) – es sucht nicht nach einem internen Startcodon (ATG) auf halbem Weg durch eine längere Sequenz. Wenn also die kodierende Sequenz Ihres echten Gens nicht genau dort beginnt, wo Sie mit dem Einfügen begonnen haben, wird die Übersetzung aus dem Rahmen verschoben. Es akzeptiert auch nur die vier Standard-DNA-Basen (A, T, G, C); Mehrdeutigkeitscodes wie N, R oder Y (häufig bei Rohsequenzierungslesungen) werden als ungültig gekennzeichnet und nicht erraten. Überprüfen Sie bei realen Labor- oder Kursarbeiten immer den Leserahmen und die Strangausrichtung anhand Ihres Quellmaterials.